Клинический центр 1-го МГМУ им. И.М.Сеченова состоит из 17-ти разнопрофильных клиник, централизованной клинико-диагностической лаборатории, 16-ти лечебно-диагностических служб, отдела лучевой диагностики, включающего 7 подразделений, а также поликлиники для сотрудников и студентов, центральной научной медицинской библиотеки и ботанического сада.